O pravilnosti poslovanja Biotehniškega centra Naklo v letu 2017 je računsko sodišče izreklo mnenje s pridržkom, saj so bile ugotovljene nepravilnosti pri vzpostavitvi ustrezne evidence o dnevni izrabi delovnega časa in pri ureditvi opravljanja dela na domu. Pri nabavi konvencionalnih in ekoloških živil ter pisarniškega materiala zavod ni upošteval okoljskih zahtev, živila pa je nabavljal tudi pri dobaviteljih, ki jih ni izbral po enem izmed predpisanih postopkov. S svojimi zaposlenimi je v nasprotju s predpisi sklepal avtorske in podjemne pogodbe. Stanja sredstev in obveznosti do virov sredstev na dan 31. 12. 2017 ni uskladil z dejanskim stanjem, ugotovljenim s popisom. Računsko sodišče je zavodu podalo priporočilo za boljše poslovanje in od njega zahtevalo predložitev odzivnega poročila.